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.hmmessage P
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body.hmmessage
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<body class='hmmessage'>
Dear sir<br><br>I have tested a scecond run the error occurred at the same point.<br>but the error message seems to be a little different. This time is <br>"&nbsp; from&nbsp; pzpotrf&nbsp; : error #&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 841" not the "error #&nbsp; 1"<br><br>vega<br><br><br><br>&nbsp; Initial potential from superposition of free atoms<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Check: negative starting charge=&nbsp;&nbsp; -0.059468<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; starting charge&nbsp; 919.99822, renormalised to&nbsp; 960.00000<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; negative rho (up, down):&nbsp; 0.621E-01 0.000E+00<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Starting wfc are&nbsp; 720 atomic wfcs<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; total cpu time spent up to now is&nbsp;&nbsp;&nbsp; 193.35 secs<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; per-process dynamical memory:&nbsp;&nbsp; 440.5 Mb<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Self-consistent Calculation<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; iteration #&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ecut=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 25.00 Ry&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; beta=0.30<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Davidson diagonalization with overlap<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ethr =&nbsp; 1.00E-02,&nbsp; avg # of iterations =&nbsp; 3.0<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; negative rho (up, down):&nbsp; 0.621E-01 0.000E+00<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; total cpu time spent up to now is&nbsp;&nbsp;&nbsp; 751.23 secs<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; total energy&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = -7247.96686204 Ry<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Harris-Foulkes estimate&nbsp;&nbsp; = -7258.07931507 Ry<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; estimated scf accuracy&nbsp;&nbsp;&nbsp; &lt;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 22.98796274 Ry<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; iteration #&nbsp; 2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ecut=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 25.00 Ry&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; beta=0.30<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Davidson diagonalization with overlap<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ethr =&nbsp; 2.39E-03,&nbsp; avg # of iterations =&nbsp; 3.0<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; negative rho (up, down):&nbsp; 0.619E-01 0.000E+00<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; total cpu time spent up to now is&nbsp;&nbsp; 1305.89 secs<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; total energy&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = -7252.71923993 Ry<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Harris-Foulkes estimate&nbsp;&nbsp; = -7254.10096935 Ry<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; estimated scf accuracy&nbsp;&nbsp;&nbsp; &lt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.63104492 Ry<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; iteration #&nbsp; 3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ecut=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 25.00 Ry&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; beta=0.30<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Davidson diagonalization with overlap<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ethr =&nbsp; 4.82E-04,&nbsp; avg # of iterations =&nbsp; 3.0<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; negative rho (up, down):&nbsp; 0.623E-01 0.000E+00<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; total cpu time spent up to now is&nbsp;&nbsp; 1815.69 secs<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; total energy&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = -7253.30999271 Ry<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Harris-Foulkes estimate&nbsp;&nbsp; = -7253.45932341 Ry<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; estimated scf accuracy&nbsp;&nbsp;&nbsp; &lt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.71665018 Ry<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; iteration #&nbsp; 4&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ecut=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 25.00 Ry&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; beta=0.30<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Davidson diagonalization with overlap<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ethr =&nbsp; 7.47E-05,&nbsp; avg # of iterations =&nbsp; 2.8<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; negative rho (up, down):&nbsp; 0.651E-01 0.000E+00<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; total cpu time spent up to now is&nbsp;&nbsp; 2328.29 secs<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; total energy&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = -7253.35733982 Ry<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Harris-Foulkes estimate&nbsp;&nbsp; = -7253.39732100 Ry<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; estimated scf accuracy&nbsp;&nbsp;&nbsp; &lt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.25146000 Ry<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; iteration #&nbsp; 5&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ecut=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 25.00 Ry&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; beta=0.30<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Davidson diagonalization with overlap<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ethr =&nbsp; 2.62E-05,&nbsp; avg # of iterations =&nbsp; 2.0<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; negative rho (up, down):&nbsp; 0.642E-01 0.000E+00<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; total cpu time spent up to now is&nbsp;&nbsp; 2844.30 secs<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; total energy&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = -7253.38499361 Ry<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Harris-Foulkes estimate&nbsp;&nbsp; = -7253.39168977 Ry<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; estimated scf accuracy&nbsp;&nbsp;&nbsp; &lt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.04134125 Ry<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; iteration #&nbsp; 6&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ecut=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 25.00 Ry&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; beta=0.30<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Davidson diagonalization with overlap<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ethr =&nbsp; 4.31E-06,&nbsp; avg # of iterations = 14.0<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; negative rho (up, down):&nbsp; 0.646E-01 0.000E+00<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; total cpu time spent up to now is&nbsp;&nbsp; 3646.59 secs<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; total energy&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = -7253.38599587 Ry<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Harris-Foulkes estimate&nbsp;&nbsp; = -7253.38854982 Ry<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; estimated scf accuracy&nbsp;&nbsp;&nbsp; &lt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.01379492 Ry<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; iteration #&nbsp; 7&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ecut=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 25.00 Ry&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; beta=0.30<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Davidson diagonalization with overlap<br><br>&nbsp;%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; from&nbsp; pzpotrf&nbsp; : error #&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 841<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; problems computing cholesky decomposition <br>&nbsp;%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; stopping ...<br>[node5:16759] MPI_ABORT invoked on rank 18 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 0<br>forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)<br><br><font size="4"><span style="font-family: Lucida Handwriting,Cursive;">Vega Lew</span></font><br>PH.D Candidate in Chemical Engineering<br>
State Key Laboratory of Materials-oriented Chemical Engineering<br>College of Chemistry and Chemical Engineering<br>Nanjing University of Technology, 210009, Nanjing, Jiangsu, China<br><br><br /><hr />Discover the new Windows Vista <a href='http://search.msn.com/results.aspx?q=windows+vista&mkt=en-US&form=QBRE' target='_new'>Learn more!</a></body>
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