<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />
<title></title>
</head>
<style type="text/css">
<!--
        #send_mail { 
        font-family: "Courier New";
        background:#FFFFFF;
        color:#000000;
        }

#send_mail a {
        color:#999999
        }

#send_mail a:hover {
        color:#0000FF
        }

#send_mail div { 
        color:#000000;
        font-family: "Courier New";
        font-size:14px;
        line-height:150%;
        }

#send_mail .usersign {
        line-height:100%;
        }
-->
</style>
<body id="send_mail">
<div>Dear Lo_wan: <BR>
    I am using SGI too, and  I sometimes encounter the problems like yours, which, however, always can be  <BR>
attributed to two reasons below: <BR>
(1) one/some of the nodes in paralleled jobs can not work well ; <BR>
(2) or can not commute well. <BR>
So, maybe you can change your job subscripts(including reducing No. of nodes), then see what happens. <BR>
In addition, I encountered some problems when I compile the packages with f90 compiler, and could you tell me <BR>
what is your compiler? Thanks! <BR>
<BR>
Best Wishes! <BR>
Yours Sincerely <BR>
L.F.Huang <BR>
<BR>
</FONT><FONT color=#444444>> Date: Tue, 11 Nov 2008 09:55:55 +0800 <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> From: Lo_wan_2005XW  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> Subject: [Pw_forum] Why my test-calculation is so slowly? SGI4700 for <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>         Si take about 1 hours <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> To:  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> Message-ID:  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> Content-Type: text/plain; charset="gb2312" <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> Dear PWscf users <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> I just download the code and install it in our SGI-4700 without any warnning or error. <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> After that, I try to do the example-calculation (example01). <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> My machine is SGI-Altex-4700, so I change the the following line in the file of run_example  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> $PW_COMMAND  si.scf.$diago.out <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> to  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> $PARA_PREFIX $PW_COMMAND  si.scf.$diago.out <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> I set  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> PARA_PREFIX="mpirun -np 12" <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> After that, I type ./run_example <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> I can see the following in the screen: <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> sgi4700:~/Quantum-Espresso/espresso-4.0.3/examples/example01</FONT><FONT color=#444444>> ./run_example  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> /disk2/Quantum-Espresso/espresso-4.0.3/examples/example01 : starting <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> This example shows how to use pw.x to calculate the total energy and <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> the band structure of four simple systems: Si, Al, Cu, Ni. <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   executables directory: /disk2/Quantum-Espresso/espresso-4.0.3/bin <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   pseudo directory:      /disk2/Quantum-Espresso/espresso-4.0.3/pseudo <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   temporary directory:   /disk2/tmp <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   checking that needed directories and files exist... done <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   running pw.x as: mpirun -np 12 /disk2/Quantum-Espresso/espresso-4.0.3/bin/pw.x -npool 4 <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   running bands.x as: mpirun -np 12 /disk2/Quantum-Espresso/espresso-4.0.3/bin/bands.x -npool 4 <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   cleaning /disk2/xgwan/tmp... done <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   running the scf calculation for Si... <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>   <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> By using "top", I can find there are 12 pw.x.  My machine take about 2 hours to finish this simple calculation. It is quite strange!  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> I compare the my output and the data saved in referece-directory, it shows that my result, like total energy, is right comparing with the referenced data. <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> Attached pleased find my output data. <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> I will appreciate if someone can kindly tell me the possible reason for it.  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> Thanks <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
</FONT><FONT color=#444444>> XW <BR>
</FONT><FONT color=#444444>>  <BR>
------ <BR>
====================================================================== <BR>
L.F.Huang(黄良锋) <A href=mailto:lfhuang@theory.issp.ac.cn>lfhuang@theory.issp.ac.cn</A> <BR>
====================================================================== <BR>
Add: Research Laboratory for Computational Materials Sciences, <BR>
Instutue of Solid State Physics,the Chinese Academy of Sciences, <BR>
P.O.Box 1129, Hefei 230031, P.R.China <BR>
Tel: 86-551-5591464-328(office) <BR>
Fax: 86-551-5591434 <BR>
Web: <A href=http://theory.issp.ac.cn target=_blank>http://theory.issp.ac.cn</A</FONT><FONT color=#444444>> (website of our theory group) <BR>
<A href=http://www.issp.ac.cn target=_blank>http://www.issp.ac.cn</A</FONT><FONT color=#444444>>    (website of our institute) <BR>
====================================================================== <BR>
</div>


</body>
</html>