<div>Dear Lin, </div>
<div>Thank you very much for your answer. I will definitely go through the archives now you have mentioned supercell approach. </div>
<div> </div>
<div>Best Regards,</div>
<div>Vikas<br><br></div>
<div class="gmail_quote">On Wed, Jun 2, 2010 at 5:07 AM, Ngoc Linh Nguyen <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:nnlinh@sissa.it">nnlinh@sissa.it</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<div>
<div></div>
<div class="h5">Vikas Varshney wrote:<br>&gt; Dear All,<br>&gt;<br>&gt; My final motivation is to simulate adsorption of several small<br>&gt; molecules on Al2O3 slab. The strategy I am undertaking (and hence I<br>&gt; have few questions) is below. Please correct me if I am wrong at any<br>
&gt; stage of my calculation.<br>&gt;<br>&gt; I want to get the ground state of the Al2O3 slab. In this regard, I<br>&gt; got the unit cell of Al2O3 which is trigonal ( Space group R-3c, point<br>&gt; group D3d, 30 atoms) . This is not the primitive unit cell (which is<br>
&gt; rhombhohedral and contain 10 atoms). The reason is to eventually<br>&gt; simulate 0 0 1 surface. It seems that the structure consist of 2 basis<br>&gt; atoms. The rest are defined by different symmetry operations for the<br>
&gt; point group of Al2O3.<br>&gt;<br>&gt; Is is possible to make use of symmetry operations and run the<br>&gt; calculation on unit cell of Al2O3 by specifying only two basis atoms<br>&gt; and then run slab calculation with 30 atoms? Or should I just create<br>
&gt; a 30 atom unit cell with vacuum along Z direction in a slab geometry<br>&gt; and relax it?<br></div></div>I am not clear about your question much.<br>Anyway, I do the simulation of adsorption on the slab by form a<br>
supercell that stores the substrate + vacuum + adsorbate atoms.<br>You can see in previous archives to understand how to form a supercell.<br><br>Best,<br><br>Linh<br><br><br><br><br><br><br><br><br>&gt; Best Regards,<br>
&gt; Vikas<br>&gt;<br>&gt;<br>&gt; ------------------------------------------------------------------------<br>&gt;<br>&gt; _______________________________________________<br>&gt; Pw_forum mailing list<br>&gt; <a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a><br>
&gt; <a href="http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum</a><br>&gt;<br><br><br>--<br>-----------------------------------------------------<br> Nguyen Ngoc Linh, PhD Student<br>
 c/o:   SISSA &amp; CNR-INFM Democritos,<br>       via Beirut 2-4, 34014 Trieste (Italy)<br> email: <a href="mailto:nnlinh@sissa.it">nnlinh@sissa.it</a><br> phone: +39 04 03787 319<br> skype: ngoclinh84phys<br>-----------------------------------------------------<br>
&quot;The physics is theoretical but the fun is real&quot;<br><br><br>_______________________________________________<br>Pw_forum mailing list<br><a href="mailto:Pw_forum@pwscf.org">Pw_forum@pwscf.org</a><br><a href="http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum" target="_blank">http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum</a><br>
</blockquote></div><br>