<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META content="text/html; charset=utf-8" http-equiv=Content-Type>
<META name=GENERATOR content="MSHTML 8.00.6001.19019">
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT size=2 face=Arial>Alexander,</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Arial></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Arial>According to your reply to my message, you actually 
applied 64 CPU cores </FONT></DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Arial>(16 nodes, 4 cores per node), this should have no 
problem unless the policy</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Arial>of using your cluster prohibited it. Once upon a 
time, we had such a policy</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Arial>on our cluster: an job occupies at most 32 CPU 
cores, otherwise put it into</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Arial>sequential queue.</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Arial></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Arial>Maybe, you should ask your administrator whether 
there is such a policy ...</FONT></DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Arial>zhou huiqun</FONT></DIV>
<DIV><FONT size=2 face=Arial>@earth sciences, nanjing university, 
china</FONT></DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<BLOCKQUOTE 
style="BORDER-LEFT: #000000 2px solid; PADDING-LEFT: 5px; PADDING-RIGHT: 0px; MARGIN-LEFT: 5px; MARGIN-RIGHT: 0px">
  <DIV style="FONT: 10pt arial">----- Original Message ----- </DIV>
  <DIV 
  style="FONT: 10pt arial; BACKGROUND: #e4e4e4; font-color: black"><B>From:</B> 
  <A title=agkvashnin@gmail.com href="mailto:agkvashnin@gmail.com">Alexander G. 
  Kvashnin</A> </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>To:</B> <A title=pw_forum@pwscf.org 
  href="mailto:pw_forum@pwscf.org">PWSCF Forum</A> </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Sent:</B> Tuesday, March 08, 2011 12:24 
  AM</DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Subject:</B> Re: [Pw_forum] НА: Re: problem 
  in MPI running of QE (16 processors)</DIV>
  <DIV><BR></DIV>
  <DIV>Dear all<BR></DIV>
  <DIV><BR></DIV>
  <DIV>I tried to use full paths, but it didn't give positive results. It wrote 
  an error message &nbsp;</DIV>
  <DIV><BR></DIV>
  <DIV>application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 0) - process 0</DIV>
  <DIV><BR></DIV><BR>
  <DIV class=gmail_quote>On 7 March 2011 10:30, Alexander Kvashnin <SPAN 
  dir=ltr>&lt;<A 
  href="mailto:agkvashnin@gmail.com">agkvashnin@gmail.com</A>&gt;</SPAN> 
  wrote:<BR>
  <BLOCKQUOTE 
  style="BORDER-LEFT: #ccc 1px solid; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; PADDING-LEFT: 1ex" 
  class=gmail_quote>
    <DIV>
    <DIV class=h5>Thanks, I tried to use "&lt;" instead of "-in" it also didn't 
    work.<BR>OK,I will try to use full paths for input and output, and answer 
    about result.<BR><BR>----- Исходное сообщение -----<BR>От: Omololu Akin-Ojo 
    &lt;<A 
    href="mailto:prayerz.omo@gmail.com">prayerz.omo@gmail.com</A>&gt;<BR>Отправлено: 
    7 марта 2011 г. 9:56<BR>Кому: PWSCF Forum &lt;<A 
    href="mailto:pw_forum@pwscf.org">pw_forum@pwscf.org</A>&gt;<BR>Тема: Re: 
    [Pw_forum] НА: Re: problem in MPI running of QE (16 processors)<BR><BR>Try 
    to see if specifying the full paths help.<BR>E.g., try something 
    like:<BR><BR>mpiexec /home/MyDir/bin/pw.x -in &nbsp;/scratch/MyDir/graph.inp 
    &gt;<BR>/scratch/MyDir/graph.out<BR><BR>(where /home/MyDir/bin is the full 
    path to your pw.x and<BR>/scratch/MyDir/graph.inp is the full path to your 
    output ....)<BR><BR>( I see you use "-in" instead of "&lt;" to indicate the 
    input. I don't<BR>know too much but _perhaps_ you could also _try_ using 
    "&lt;" instead of<BR>"-in") .<BR><BR>o.<BR><BR>On Mon, Mar 7, 2011 at 7:31 
    AM, Alexander Kvashnin &lt;<A 
    href="mailto:agkvashnin@gmail.com">agkvashnin@gmail.com</A>&gt; 
    wrote:<BR>&gt; Yes, I wrote<BR>&gt;<BR>&gt; #PBS -l 
    nodes=16:ppn=4<BR>&gt;<BR>&gt; And in userguide of MIPT-60 wrote,that 
    mpiexec must choose number of<BR>&gt; processors automatically, that's why I 
    didn't write anything else<BR>&gt;<BR>&gt;<BR>&gt; 
    ________________________________<BR>&gt; ÐžÑ‚: Huiqun Zhou &lt;<A 
    href="mailto:hqzhou@nju.edu.cn">hqzhou@nju.edu.cn</A>&gt;<BR>&gt; 
    ÐžÑ‚правлено: 7 Ð¼Ð°Ñ€Ñ‚а 2011 Ð³. 7:52<BR>&gt; ÐšÐ¾Ð¼Ñƒ: PWSCF 
    Forum &lt;<A 
    href="mailto:pw_forum@pwscf.org">pw_forum@pwscf.org</A>&gt;<BR>&gt; 
    Ð¢ÐµÐ¼Ð°: Re: [Pw_forum] problem in MPI running of QE (16 
    processors)<BR>&gt;<BR>&gt; How did you apply number of node, procs per node 
    in your job<BR>&gt; script?<BR>&gt;<BR>&gt; #PBS -l 
    nodes=?:ppn=?<BR>&gt;<BR>&gt; zhou huiqun<BR>&gt; @earth sciences, nanjing 
    university, china<BR>&gt;<BR>&gt;<BR>&gt; ----- Original Message 
    -----<BR>&gt; From: Alexander G. Kvashnin<BR>&gt; To: PWSCF Forum<BR>&gt; 
    Sent: Saturday, March 05, 2011 2:53 AM<BR>&gt; Subject: Re: [Pw_forum] 
    problem in MPI running of QE (16 processors)<BR>&gt; I create PBS task on 
    supercomputer MIPT-60 where I write<BR>&gt;<BR>&gt; mpiexec 
    ../../espresso-4.2.1/bin/pw.x -in graph.inp &gt; output.opt<BR>&gt; all 
    other<BR><BR>[Включен не весь текст исходного 
  сообщения]</DIV></DIV></BLOCKQUOTE></DIV><BR><BR clear=all><BR>-- <BR>
  <DIV>Sincerely yours</DIV>
  <DIV>Alexander G. Kvashnin</DIV>
  <DIV>--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------</DIV>
  <DIV>Student</DIV>
  <DIV>Moscow Institute of Physics and Technology &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; 
  &nbsp;<A href="http://mipt.ru/" target=_blank>http://mipt.ru/</A></DIV>
  <DIV>141700, Institutsky lane 9, Dolgoprudny, Moscow Region, Russia<BR></DIV>
  <DIV><BR></DIV>
  <DIV>Junior research scientist<BR></DIV>
  <DIV>Technological Institute for Superhard </DIV>
  <DIV>and Novel Carbon Materials &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; 
  &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; 
  <A href="http://www.ntcstm.troitsk.ru/" 
  target=_blank>http://www.ntcstm.troitsk.ru/</A></DIV>
  <DIV>142190, Central'naya St. 7a, Troitsk, Moscow Region, Russia</DIV>
  <DIV>================================================================</DIV><BR>
  <P>
  <HR>

  <P></P>_______________________________________________<BR>Pw_forum mailing 
  list<BR>Pw_forum@pwscf.org<BR>http://www.democritos.it/mailman/listinfo/pw_forum<BR></BLOCKQUOTE></BODY></HTML>