Hi all,<br><br>I am new to PWscf and XCrysden. My Input file for Bismuth Titanate is below. The output structure in XCRYSden window is seemed to be right but it is giving mssg ......... typed below. Please help or give suggestion.<br>
<br>Number of Atoms:  133<br>Number of Frames: 12<br>WARNING: Atom 1 and atom 12 are very close !!!<br>         Atom 12 deleted !!!<br>WARNING: Atom 2 and atom 122 are very close !!!<br>         Atom 122 deleted !!!<br>WARNING: Atom 3 and atom 14 are very close !!!<br>
         Atom 14 deleted !!!<br>WARNING: Atom 4 and atom 123 are very close !!!<br>         Atom 123 deleted !!!<br>WARNING: Atom 5 and atom 16 are very close !!!<br>         Atom 16 deleted !!!<br>WARNING: Atom 6 and atom 124 are very close !!!<br>
         Atom 124 deleted !!!......<br>.........................................................<br>......<br><br> and because of this PWScf  SCF run stops and gives the mssg wrong atomic co-ordinates.<br><br><br> &amp;control<br>
    calculation=&#39;scf&#39;,<br>    restart_mode=&#39;from_scratch&#39;,<br>    prefix=&#39;bit&#39;<br>    pseudo_dir = &#39;/home/physics/pseudo/&#39;,<br>    outdir=&#39;/home/physics/work/bit/temp&#39;<br> /<br> &amp;system<br>
    ibrav = 7, a=3.86334, b= 3.86334, c=33.2942<br>, nat =38, ntyp= 3,<br>    ecutwfc = 60.0,ecutrho=200,<br>   occupations=&#39;smearing&#39;, smearing    = &quot;methfessel-paxton&quot;, degauss=0.01,<br><br> /<br> &amp;electrons<br>
    mixing_beta = 0.50<br>    conv_thr =  1.0e-6<br>/<br> &amp;ions<br> /<br><br>ATOMIC_SPECIES<br>  Bi     208.980     Bi.pbe-d-mt.UPF<br>  Ti      47.867       Ti.pbe-sp-van_ak.UPF<br>  O     15.9994      O.pbe-van_ak.UPF<br>
ATOMIC_POSITIONS {bohr}<br>Bi             3.65032726386637    3.65032726386637    4.24815040995715<br>Bi             3.65032726386637    3.65032726386637   13.30504053709336<br>Ti             3.65032726386637    3.65032726386637   23.32581852937194<br>
O             3.65032726386637    3.65032726386637   27.75265329698888<br>O             3.65032726386637    3.65032726386637   19.74332980289407<br>Bi             0.00000000000000    0.00000000000000   35.70661018533794<br>
Bi             0.00000000000000    0.00000000000000   44.76350031247415<br>Ti             0.00000000000000    0.00000000000000   54.78427830475272<br>O             0.00000000000000    0.00000000000000   -3.70580647839191<br>
O             0.00000000000000    0.00000000000000   51.20178957827486<br>Bi             3.65032726386637    3.65032726386637      58.66876914080443<br>Bi             3.65032726386637    3.65032726386637      49.61187901366822<br>
Ti              3.65032726386637    3.65032726386637     39.59110102138964<br>O             3.65032726386637    3.65032726386637      35.16426625377269<br>O             3.65032726386637    3.65032726386637      43.17358974786750<br>
Bi             0.00000000000000    0.00000000000000   27.21030936542364<br>Bi             0.00000000000000    0.00000000000000   18.15341923828743<br>Ti              0.00000000000000    0.00000000000000    8.13264124600885<br>
O             0.00000000000000    0.00000000000000    3.70580647839191<br>O              0.00000000000000    0.00000000000000   11.71512997248671<br>Ti              3.65032726386637    3.65032726386637   31.45845977538078<br>
Ti              0.00000000000000    0.00000000000000    0.00000000000000<br>O             3.65032726386637    0.00000000000000    0.00000000000000<br>O             0.00000000000000    3.65032726386637   31.45845977538078<br>
O             0.00000000000000    3.65032726386637    0.00000000000000<br>O             3.65032726386637    0.00000000000000   31.45845977538078<br>O             3.65032726386637    0.00000000000000   15.72922988769039<br>
O             0.00000000000000    3.65032726386637   15.72922988769039<br>O             3.65032726386637    0.00000000000000   47.18768966307118<br>O             0.00000000000000    3.65032726386637   47.18768966307118<br>
O             3.65032726386637    0.00000000000000    7.40406298501923<br>O             0.00000000000000    3.65032726386637   38.86252276040002<br>O             0.00000000000000    3.65032726386637    7.40406298501923<br>
O             3.65032726386637    0.00000000000000   38.86252276040002<br>O             3.65032726386637    0.00000000000000   55.51285656574235<br>O             0.00000000000000    3.65032726386637   24.05439679036155<br>
O             0.00000000000000    3.65032726386637   55.51285656574235<br>O             3.65032726386637    0.00000000000000   24.05439679036155<br><br>K_POINTS {automatic}<br>  4 4 1 0 0 0<br><br>